8. Base de données PDB
Les structures tridimensionnelles sont déposées dans une base de données spécialisée, appelée « Protein Data Bank » (PDB, RSCB), située actuellement aux États-Unis (Rutgers, New Jersey) (http://www.rcsb.org/pdb/). Cette base de données est d'accès libre et gratuit et permet à la communauté internationale d'avoir accès aux coordonnées des structures résolues. Le dépôt des coordonnées d'une macromolécule est devenu une condition préalable à la publication des travaux de recherche dans une revue internationale de haut niveau. Il faut se rappeler que les publications sont le critère premier de jugement du travail scientifique d'un chercheur du secteur public. Le dépôt de coordonnées est une pratique moins courante dans le monde industriel où, au contraire, on ne souhaite pas communiquer aux compétiteurs les données si précieuses que constituent les coordonnées atomiques d'une structure. En 2007, 7 272 structures nouvelles ont été déposées, soit en moyenne près de 20 structures par jour. À la date de remise à jour de cette revue (octobre 2008), la PDB contenait 53 521 structures dont 85 % de structures cristallographiques.
Chaque...
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