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Toxicologie industrielleArticle de référence | Réf : SE1607 v1
Auteur(s) : Alain LOMBARD
Date de publication : 10 juil. 2018
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5.1 Les méthodes « in silico » ou cristallographiques
Elles correspondent à l’étude des relations structure-activité (QSAR) et à la modélisation de la liaison du ligand au récepteur.
La méthode QSAR (Quantitative Structure Activity Relationship) est l’établissement d’une relation quantitative entre une structure chimique et une activité sous forme d’une réactivité chimique ou d’une activité biologique. Par exemple, la présence de cycles benzéniques avec une fonction HO dans la structure chimique , comme pour l’estradiol (figure 7).
Cela consiste aussi à obtenir une relation quantifiée entre des descripteurs (polarité, moment dipolaire, coefficient de partage eau/n-octanol) et l’activité biologique de façon à apprécier l’activité biologique d’un nouveau composé uniquement par détermination de paramètres physico-chimiques.
Cela est plus aisé et rapide que les tests biologiques.
Ce même principe est appliqué dans la « Modélisation de la liaison du ligand au récepteur et la méthode cristallographique aux rayons X » développée par l’équipe de P. Balaguer .
La méthodologie utilisée ici consiste à déterminer la structure du récepteur par cristallographie, à en reproduire la structure tridimensionnelle sur ordinateur et à étudier les paramètres physico-chimiques des différents ligands susceptibles de s’y fixer, et tout particulièrement les énergies de liaison et les constantes de fixation (figure ...
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(1) - CANIVEC-LAVIER (M.-C.) - Perturbateurs Endocriniens : liens de causalité confirmés et émergents. - Colloque La problématique des perturbateurs endocriniens : Quelles solutions ? Maison de la Chimie, Paris (2017).
(2) - CARSON (R.) - Silent Spring. - Houghton Mifflin Company (1962).
(3) - DELFOSSE (V.), GRIMALDI (M.), CAVAILLÈS (V.), BALAGUER (P.), BOURGUET (W.) - Structural and functional profiling of environmental ligands for estrogen receptors. - Environ Heath Perspect 122 : 1306-1313 (2014).
(4) - EFSA - Identification/Characterisation of EDs : scientific criteria and test methods. - EFSA Journal 11(3) : 3132 [84 pp.] (2013).
(5) - FREDERIKSEN (H.) et al - Metabolism of phthalates in humans, Molecular Nutrition & Food Research. - Volume 51, Issue 7 (2007).
...
INERIS
INSERM
https://www.inserm.fr/information-en-sante/dossiers-information/perturbateurs-endocriniens
La Fondation de la maison de la chimie
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Ministère de la Transition écologique et solidaire
https://www.ecologique-solidaire.gouv.fr/perturbateurs-endocriniens
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