Dominique LAVENIER

Depuis quelques années, les progrès continus des biotechnologies sont à l'origine d'une masse considérable de données génomiques, notamment avec la possibilité de séquencer toujours plus rapidement des génomes entiers. L'architecture RDISK est un système prototype composé d'un cluster de quarante huit noeuds spécialisés, comprenant chacun un disque dur étroitement connecté à un composant FPGA. L'objectif est de filtrer ces banques de données génomiques à la volée, c'est-à-dire sans ralentir la lecture d'information en provenance des disques. En fonction de la nature des requêtes, le système se reconfigure automatiquement.