RDISK : une architecture reconfigurable pour l'exploration des banques génomiques

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RDISK : une architecture reconfigurable pour l'exploration des banques génomiques

Auteur(s) : Dominique LAVENIER

Date de publication : 10 août 2008 | Read in english

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RÉSUMÉ

Depuis quelques années, les progrès continus des biotechnologies sont à l'origine d'une masse considérable de données génomiques, notamment avec la possibilité de séquencer toujours plus rapidement des génomes entiers. L'architecture RDISK est un système prototype composé d'un cluster de quarante huit noeuds spécialisés, comprenant chacun un disque dur étroitement connecté à un composant FPGA. L'objectif est de filtrer ces banques de données génomiques à la volée, c'est-à-dire sans ralentir la lecture d'information en provenance des disques. En fonction de la nature des requêtes, le système se reconfigure automatiquement.

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AUTEUR(S)

 INTRODUCTION

L'architecture RDISK est un système prototype composé d'un cluster de 48 nœuds spécialisés comprenant chacun un disque dur étroitement connecté à un composant FPGA. L'objectif est de filtrer les banques de données génomiques à la volée, c'est-à-dire sans ralentir la lecture d'information en provenance des disques. En fonction de la nature des requêtes, le système se reconfigure automatiquement.

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DOI (DIGITAL OBJECT IDENTIFIER)

https://doi.org/10.51257/a-v1-in89

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