3. Mise en œuvre de la dynamique moléculaire
La réalisation d’une simulation commence d’abord par la définition de l’état initial caractérisé par :
la nature des particules et du potentiel ;
la position des particules ;
les conditions limites ;
le champ de vitesse des particules ;
la température initiale.
Pour simplifier l’exposé, celui-ci est limité à un ensemble d’atomes du même élément dont la vitesse moyenne est nulle (centre de gravité fixe) et sans mouvement de rotation autour du centre de gravité. Un seul potentiel interatomique est nécessaire et le choix du potentiel est directement lié à la nature des atomes et aux phénomènes physiques étudiés.
Dans la plupart des cas, la position...
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