Les biotechnologies sont un outil prometteur dans la chaîne de transformation du bois en pâte à papier. Des micro-organismes, et notamment des champignons, sécrètent des produits dégradant le bois. Certains effectuent même une dégradation très sélective éliminant la lignine et les composés indésirables du bois tout en conservant la cellulose. Leur étude a conduit au développement de techniques de contrôle de la dégradation sélective des composants du bois lors de la préparation des pâtes à papier. Deux approches sont possibles, basée soit sur l'utilisation des micro-organismes, soit sur l'application directe d'enzymes.