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Nouvelles techniques de méta-omiques pour le diagnostic de la qualité microbiologique des sols

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Nouvelles techniques de méta-omiques pour le diagnostic de la qualité microbiologique des sols

Auteur(s) : Christophe DJEMIEL, Sébastien TERRAT

Date de publication : 10 octobre 2019 | Read in english

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5. Conclusions

Prendre en compte la part biologique des sols (dans leur évaluation et leur utilisation) est devenue nécessaire, dans un contexte de transition écologique. Les technologies de méta-omiques ouvrent clairement de nouvelles possibilités, car elles permettent maintenant d’avoir une vision plus claire de la distribution des communautés, de leur expression et de leur activité. L’exploitation combinée de ces données de méta-omiques (en intégrant et/ou en associant les données obtenues de techniques différentes) permettra, à terme, de mieux comprendre comment interagissent les communautés microbiennes avec leur environnement sol.

Au regard des évolutions récentes des technologies de méta-omiques et de leurs promesses en termes d’avancées dans un avenir proche (comme les derniers développements d’Oxford Nanopore), il est possible d’envisager l’usage d’approches de méta-omiques...

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