2. Calcul d'une trajectoire de dynamique moléculaire
Pour un système de N atomes, 6N valeurs sont nécessaires pour définir l'état du système (trois valeurs de coordonnées et trois valeurs de vitesses par atome). Chaque combinaison de ces valeurs donne un point dans l'espace à 6N dimensions ; cet espace est appelé espace des phases, et une configuration de la trajectoire est donc une collection de points dans cet espace.
Les calculs de trajectoires de dynamique moléculaire s'effectuent toujours sous l'hypothèse ergodique, c'est-à-dire que la moyenne d'une quantité sur un ensemble de particules équivalentes est égale à la moyenne sur le temps d'une particule. Cet axiome de la mécanique statistique permet le calcul de propriétés moyennes du système à partir d'une simulation de dynamique moléculaire. S'il était possible de visiter tous les points de l'espace des phases, la trajectoire serait appelée ergodique et...
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Calcul d'une trajectoire de dynamique moléculaire
Méthodes pratiques de simulation
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