Applications et perspectives (dynamiques des protéines et modélisation des complexes)
Bioinformatique structurale - Bases de données et méthodes de prédiction

Il est important de rappeler qu’au-delà de l’image statique fournie par les structures cristallographiques, la dynamique joue un rôle primordial dans l’accomplissement des fonctions biologiques. La dynamique permet des changements conformationnels qui peuvent être extrêmement locaux, c’est-à-dire des rotations de chaînes latérales pour accommoder un ligand ou, au contraire, de grande ampleur, amenant des mouvements relatifs de domaines entiers, comme dans le cas des mécanismes allostériques. Les techniques de simulation de dynamique moléculaire commencent à présent à être « popularisées » au-delà de la communauté des spécialistes grâce en particulier aux efforts réalisés pour accélérer les calculs et aux progrès très importants réalisés sur la vitesse des processeurs. Des descriptions simplifiées comme l’utilisation de modèles gros grains évoqués...