Prédiction bioinformatique de la structure 2D
Bioinformatique structurale - Bases de données et méthodes de prédiction

Même si elles sont moins populaires qu’elles ne l’ont été, les méthodes de prédiction du repliement secondaire des protéines se révèlent très utiles pour guider des constructions plus élaborées de modèle structural. Comme pour toutes les méthodes de prédiction, le principe général consiste :

• à faire l’hypothèse qu’il existe une relation entre la nature de l’acide aminé et sa structure secondaire et ;

• qu’il est possible de l’identifier grâce à des méthodes statistiques de fouilles de données.

Pour cela, il est nécessaire de disposer d’un jeu d’apprentissage, c’est-à-dire un jeu de structures connues pour lesquelles la structure secondaire a été attribuée à l’aide d’un outil, par exemple DSSP. La performance de la méthode est ensuite évaluée sur un autre ensemble de structures,...