3. Mécanique moléculaire
La mécanique moléculaire est l’application directe d’un champ de forces à un système donné dans le but principal d’obtenir son énergie. Ainsi, pour une molécule dessinée sur un écran ou représentée par sa matrice de coordonnées internes (encore appelée matrice Z) ou cartésiennes, la mécanique moléculaire va nous fournir une énergie. Toutefois, cette énergie ne correspond pas à l’énergie minimale de la molécule. Pourquoi le serait-elle ? Il n’y a aucune raison que nous dessinions la conformation de la molécule, ou le système, dans son état le plus stable. Il est de ce fait, impératif d’optimiser sa structure afin qu’elle puisse être le plus conforme à la réalité ou, tout du moins, à la « réalité » exprimée par le champ de forces. Il faut donc trouver un moyen d’obtenir...
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Mécanique moléculaire