Apport des méta-omiques pour l’évaluation de la qualité des sols
Nouvelles techniques de méta-omiques pour le diagnostic de la qualité microbiologique des sols

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Apport des méta-omiques pour l’évaluation de la qualité des sols
Nouvelles techniques de méta-omiques pour le diagnostic de la qualité microbiologique des sols

Auteur(s) : Christophe DJEMIEL, Sébastien TERRAT

Date de publication : 10 octobre 2019 | Read in english

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3. Apport des méta-omiques pour l’évaluation de la qualité des sols

3.1 Enjeux et verrous pour rendre les méta-omiques utilisables en bio-indicateur opérationnel

Les « méta-omiques » et les développements technologiques récents associés ont permis de mieux caractériser la diversité taxonomique, les potentialités métaboliques, l’expression et l’activité des communautés microbiennes des sols. Seulement, l’utilisation en recherche d’une approche « méta-omique » ne fait pas d’elle une technique éprouvée. Elle doit préalablement répondre à un certain nombre de critères comme :

  • ses niveaux de répétabilité, de sensibilité et de reproductibilité qui doivent être connus et maîtrisés ;

  • la standardisation des procédures associées à l’utilisation de cette technique ;...

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