2. Techniques de méta-omiques : principe, méthodologies et applications
Depuis les années 1980, l’analyse des communautés microbiennes des sols a vu émerger un nouveau paradigme (figure
5
). En effet, les analyses « pasteuriennes », permettant de caractériser des souches pures cultivées en laboratoire ont cédé la place à des approches basées sur la caractérisation de matériel biologique, notamment l’ADN, mais aussi d’autre sources biologiques, comme l’ARN, les protéines ou les métabolites. Ce matériel est maintenant directement extrait à partir d’un échantillon environnemental permettant de passer de l’étude d’un micro-organisme isolé à l’analyse des communautés microbiennes dans leur environnement naturel, ce sont les « méta-omiques » (figure...
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Techniques de méta-omiques : principe, méthodologies et applications