Prototype RDISK
RDISK : une architecture reconfigurable pour l'exploration des banques génomiques

Ajouter à la bibliothèque

IN89 V1 Recherche et innovation

Prototype RDISK
RDISK : une architecture reconfigurable pour l'exploration des banques génomiques

Auteur(s) : Dominique LAVENIER

Date de publication : 10 août 2008 | Read in english

Ajouter à la bibliothèque Ajouter à la bibliothèque

Logo Techniques de l'Ingenieur Cet article est réservé aux abonnés
Pour explorer cet article plus en profondeur Consulter un extrait gratuit

Déjà abonné ?

2. Prototype RDISK

2.1 Motivations

Le système RDISK peut être vu comme un cluster spécialisé pour la recherche d'information dans les grandes masses de données. Il a été développé en priorité pour l'extraction d'information génomique, mais d'autres types de données peuvent être manipulés, sans aucune restriction. L'idée maîtresse est d'être capable de parcourir rapidement des banques de données volumineuses, et d'extraire au vol toute information utile pour un traitement ultérieur plus complexe. Les deux exemples suivants illustrent notre propos : la recherche d'alignements et la recherche de motifs.

Comme nous l'avons esquissé précédemment, un alignement peut être recherché sur la base d'un point d'ancrage qui correspond à un mot de W caractères présent à la fois dans la séquence...

Cet article est réservé aux abonnés
Logo Techniques de l'Ingenieur

Cet article est réservé aux abonnés. Il vous reste 92 % à découvrir.

Cet article est réservé aux abonnés Consulter un extrait gratuit

Déjà abonné ?


Article inclus dans l'offre

"Bioprocédés et bioproductions"

( 167 articles )

Une base complète d’articles

Actualisée et enrichie d’articles validés par nos comités scientifiques.

Services

Quiz, médias, tableaux, formules, vidéos, etc.

Des modules pratiques

Opérationnels et didactiques, pour garantir l'acquisition des compétences transverses.

Des avantages inclus

Un ensemble de services exclusifs en complément des ressources.

Voir le détail de l'offre

Dans les ressources documentaires

Reconnaissance des formes

Discipline à la fois ancienne de par son histoire et très jeune de par ses multiples évolutions au cours ...

Microprocesseurs - Approche générale

Les microprocesseurs sont au cœur des systèmes numériques. Ils permettent le développement de logiciels t...

Introduction à l'architecture des ordinateurs

L'article commence par une brève histoire des machines informatiques et introduit ensuite les principes d...

Hiérarchie mémoire : mémoire virtuelle

Cet article décrit les principes et les implémentations de la mémoire virtuelle. Cette dernière offre à l...

Tous les livres blancs
Article Créer de la confiance avec les blockchains
24 juillet 2018
Créer de la confiance avec les blockchains

En 2008 Satoshi Nakamoto définissait un nouveau modèle de monnaies, dont l'émission et la gestion s'opèrent sur un réseau pair-à-pair sans contrôle centralisé. ...

Toutes les actualités

Inscrivez-vous aux newsletters !

Contactez-nous