Puces à ADN

1 - De la notion de cellule à celle de transcriptome

• 1.1 - La cellule
• 1.2 - L’ADN
  Figure 1 - La cellule eucaryote Figure 2 - Structure de l’ADN
• 1.3 - Notion de génome
• 1.4 - Du génome au transcriptome
  Figure 3 - Passage du gène à la protéine

2 - Les puces à ADN

• 2.1 - Principe
  Figure 4 - Greffage des sondes sur la puce Figure 5 - Principe de l’hybridation compétitive
• 2.2 - Les différentes étapes de la réalisation d’une puce à ADN sur lame de verre
  Figure 6 - Production des sondes par PCR Figure 7 - Schéma de dépôt des sondes

3 - Acquisition de l’image et analyse des données

• 3.1 - Localisation des spots
• 3.2 - Segmentation des spots
  Figure 10 - Image illustrant les différentes méthodes de calcul de bruit de fond
• 3.3 - Extraction des données
  Figure 11 - Plate-forme du Génopôle d’Evry Figure 12 - Image de la totalité du transcriptome de la levure (6 300 gènes)

4 - Principales utilisations des puces à ADN

• 4.1 - Dynamique du transcriptome
• 4.2 - Signatures moléculaires
• 4.3 - Analyse des voies biochimiques
• 4.4 - Génomique fonctionnelle
• 4.5 - Action des médicaments

5 - Conclusion