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Auteur(s)
-
Sandrine LOUIS : Responsable Information médicale et documentation, entreprise de biotechnologies
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Lire l’articleINTRODUCTION
Vous utilisez PubMed intuitivement pour chercher des articles, mais vous ne savez pas comment restreindre ou, au contraire, élargir vos recherches.
Cette fiche vous permettra de connaître les fonctions avancées de PubMed, et donc de pouvoir restreindre ou cibler une recherche bibliographique.
Les forces et les faiblesses de cette base de données seront rappelées pour comprendre comment affiner ses résultats.
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Écrire une stratégie de recherche dans PubMed1. Utiliser l’indexation ou non pour rechercher dans PubMed
PubMed est l’interface d’interrogation de la banque de données bibliographiques médicales Medline et d’autres sources ; elle est gratuitement accessible. Elle contient plus de 37 millions de références à ce jour et possède des articles publiés depuis 1920. La recherche y est maintenant facile, car le moteur de recherche explore de lui-même le thésaurus et traduit la requête.
Mais, selon que l’on a peu ou, au contraire, beaucoup trop de résultats, certaines fonctionnalités doivent être connues pour exploiter au mieux cette ressource.
1.1 Utiliser les descripteurs
Les descripteurs correspondent à plus de 30 000 mots-clés (MeSH, Medical Subject Headings). Il s’agit d’un vocabulaire contrôlé (les mots ont des relations hiérarchiques) et indexé. Les mots sont rangés par catégorie. Ils évoluent au fil du temps.
Les termes MeSH permettent de ne pas oublier de synonyme.
Prenons l’exemple de la maladie de Pompe, une maladie génétique rare. Les synonymes de la maladie de Pompe (Pompe disease) sont « Glucogen Storage Disease Type II » ou « Acide Maltase Deficiency ».
Si l’on est débutant, et que l’on veut être sûr d’utiliser tous les synonymes parce qu’on ne connaît pas encore très bien le thème de la recherche, une première approche par le MeSH est préférable.
On obtient ainsi une liste des différents synonymes et entrées dans le thésaurus MeSH de la maladie de Pompe (non exhaustive).
Il apparaît alors difficile, lorsque l’on fait une recherche avancée, de tous les combiner manuellement.
Le terme MeSH a été introduit en 1989 bien que la maladie de Pompe soit décrite depuis 1975. Il faudra être vigilant sur le fait que des articles publiés entre 1975 et 1989 sur cette pathologie pourront ne pas contenir le descripteur MeSH associé si son indexation n’a pas été revue.
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Outil
Exemple d’une recherche PubMed utilisant ou non les descripteurs (Outil
fic1066m1.docx
).Cet exemple de recherche sur le terme Pompe disease vous démontre la pertinence d’une recherche effectuée dans PubMed.
PubMed® comprend plus de 37 millions de citations de littérature biomédicale provenant de Medline, de revues des sciences de la vie et de livres en ligne.
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