5. Méthodes de séquençage de nouvelle génération
5.1 Séquençage de nouvelle génération
Depuis quelques années, les méthodes de séquençage de nouvelle génération (NGS) associées à de puissantes approches bioinformatiques révolutionnent la microbiologie alimentaire. Ces technologies se développent rapidement, avec des améliorations permanentes et une diminution continue des coûts. En microbiologie alimentaire, les méthodes NGS sont principalement utilisées de deux manières.
La première consiste à déterminer la séquence complète du génome d’une colonie bactérienne unique en culture. La détermination de la séquence complète d’un génome a un pouvoir hautement résolutif comparé aux systèmes de détection par PCR. Elle permet en outre de typer avec précision des souches bactériennes et de faciliter considérablement...
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Méthodes de séquençage de nouvelle génération
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