Des biopuces optiques aux biopuces dynamiques
Biopuces dynamiques et imagerie en mode de plasmon de surface
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Des biopuces optiques aux biopuces dynamiques
Biopuces dynamiques et imagerie en mode de plasmon de surface

Auteur(s) : Pierre LECARUYER, Michael CANVA

Date de publication : 10 déc. 2008 | Read in English

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RÉSUMÉ

Les nouvelles générations de systèmes de biopuces, les biopuces dynamiques, permettent d’accéder à la cinétique des interactions biomoléculaires et devraient révolutionner leurs caractérisations. Ces systèmes ont des applications tant en recherche qu’en outil de routine pour l’identification de signatures moléculaires. La méthode de choix repose actuellement sur des techniques d’imagerie en mode de résonance de plasmon de surface. La simplicité de l’utilisation des biopuces, ainsi que sa fiabilité, en font un outil majeur pour l’analyse généralisée, en temps réel et à faible coût, de molécules en faible quantité.

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Auteur(s)

  • Pierre LECARUYER : Doctorant au laboratoire Charles Fabry de l'Institut d'optique

  • Michael CANVA : Directeur de recherche - Laboratoire Charles Fabry de l'Institut d'optique - Institut d'optique Graduate School, Université Paris Sud, CNRS

INTRODUCTION

Nouvelles générations de systèmes de biopuces, les biopuces dynamiques permettent d'accéder à la cinétique des interactions biomoléculaires (figure 1) et devraient révolutionner leurs caractérisations. Ces systèmes peuvent avoir des applications tant en recherche qu'en outil de routine pour l'identification de signatures moléculaires. La méthode de choix repose actuellement sur des techniques d'imagerie en mode de résonance de plasmon de surface.

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1. Des biopuces optiques aux biopuces dynamiques

Afin d’analyser et de mieux comprendre son environnement, l’homme a développé de nombreux capteurs physiques et chimiques de plus en plus perfectionnés lui permettant de mesurer toutes sortes de paramètres. Dans des secteurs tels que le biomédical, l’industrie chimique ou l’environnement nécessitant des analyses biomoléculaires, la miniaturisation des capteurs prend tout son sens afin de pallier aux problèmes éventuels de quantité de réactifs ou d’utilisation sur le terrain. S’appuyant, d’une part, sur l’essor du domaine des télécoms (fibres, optique intégrée, sources, moyens de traitement…), et d’autre part, sur le développement ces vingt dernières années de la génomique, le développement de systèmes à haute capacité d’informations a permis l’apparition de nouveaux outils appelés biopuces optiques permettant de détecter, analyser et caractériser de nombreuses interactions biomoléculaires. La biopuce optique est ainsi une véritable plate-forme technologique, fruit de l’alliance de plusieurs disciplines scientifiques (biologie, chimie, optique, bioinformatique, microélectronique, etc.) permettant des analyses à haut débit d'information, sans interaction mécanique avec la quantité à détecter.

Cependant, si la grande capacité d’analyse en parallèle apporte un avantage considérable aux biopuces optiques, notamment dans le cadre d’analyse à grande échelle de gènes d'organismes toujours plus nombreux, ces premières biopuces optiques ont été basées sur la détection d’un marqueur émettant un signal de fluorescence ou de radioactivité  . Ces systèmes nécessitent donc un marquage préalable, ce qui a un coût et qui peut potentiellement modifier les interactions que l’on cherche à caractériser, et n'est pas envisageable pour certaines applications. Surtout, les systèmes conventionnels actuellement disponibles sont basés sur une mesure point final de la réaction...

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BIBLIOGRAPHIE

  • (1) - SOULARUE (P.), GIDROL (X.) -   Puces à ADN  -  [RE 6], Bioprocédés (2002).

  • (2) - GIDROL (X.), BAGHDOYAN (S.), ROUPIOZ (Y.) -   Les biopuces  -  [RE 17], Bioprocédés (2004).

  • (3) - LECARUYER (P.), MANNELLI (I.), COURTOIS (V.), GOOSSENS (M.), CANVA (M.) -   Surface plasmon resonance imaging as a multidimensional surface characterization instrument – application to biochip genotyping  -  Analytica Chimica Acta 573, 533-540 (2006).

  • (4) - L. MOISEEV (L.), SELIM UNLU (M.), SWAN (A.K.), GOLDBERG (B.B.), CANTOR (C.R.) -   DNA conformation on surfaces measured by fluorescence self-interference  -  PNAS 2006, 103, n° 8, 2623-2628 (2006).

  • (5) - LECARUYER (P.), MAILLART (E.), CANVA (M.), ROLLAND (J.) -   Generalization of the Rouard method to an absorbing thin film stack and application to surface plasmon resonance  -  Applied Optics, 45, Issue 33, 8419-8423 (2006).

  • (6)...

1 Sites à consulter

Catalogue en ligne http://www.abes.fr/abes/index.html

Thèses disponibles en ligne  http://tel.archives-ouvertes.fr/

HAUT DE PAGE

2 Brevet déposé

Brevet FR n° 05 12 594, « Procédé d'auto-calibration de biopuces » – CNRS (13/12/2005). Étendu international PCT/EP2006/069683 – (13/12/2006).

HAUT DE PAGE

3 Annuaire

HAUT DE PAGE

3.1 Constructeurs. Fournisseurs. Distributeurs (liste non exhaustive)

ACEA Biosciences  http://www.aceabio.com/Products/index.htm

Affymetrix  http://www.affymetrix.com/index.affx

Akubio  http://www.akubio.com/

Applied Biophysics  ...

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