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Modélisation statistique de données spatialisées
Analyse spatiale pour l’épidémiologie - Méthodes et outils
MED4002 v1 Article de référence

Modélisation statistique de données spatialisées
Analyse spatiale pour l’épidémiologie - Méthodes et outils

Auteur(s) : Marc SOURIS

Date de publication : 10 févr. 2024 | Read in English

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Présentation

1 - Cartographie

2 - Analyse de la distribution spatiale

3 - Analyse spatiale du risque

4 - Modélisation statistique de données spatialisées

  • 4.1 - Modélisation statistique
  • 4.2 - Modèles spatiaux
  • 4.3 - Hétérogénéité spatiale des paramètres et les modèles GWR

5 - Analyses et modélisations spatio-temporelles

6 - Conclusion

7 - Glossaire

Sommaire

Présentation

RÉSUMÉ

La localisation géographique apporte une information importante dans la détection des facteurs de risque qui interviennent dans l’émergence et la diffusion d’un phénomène de santé. L’analyse spatiale en épidémiologie est l’ensemble des techniques d'analyse qui utilisent la distribution spatiale du phénomène afin d'en identifier les facteurs de risque et d’en caractériser les processus. Cet article décrit les principales méthodes et outils d’analyse spatiale utilisés en épidémiologie et géographie de la santé.

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Auteur(s)

  • Marc SOURIS : Directeur de Recherche Émérite - UMR « Unité des virus émergents », Aix-Marseille Univ. – IRD – INSERM, Marseille, France

INTRODUCTION

Cet article expose en détail les différentes méthodes utilisées en analyse spatiale pour l’épidémiologie. Il fait suite à l’article [MED 4 001] qui en expose les bases conceptuelles. La nature bidimensionnelle de la localisation géographique implique que les méthodes de représentation et les techniques statistiques standards pour traiter des ensembles de variables essentiellement univariées doivent être complétées par des méthodes plus sophistiquées. Le terme « analyse spatiale » est ainsi utilisé pour décrire les techniques d’analyse, essentiellement statistiques, qui utilisent la localisation géographique. L’analyse spatiale d’un phénomène de santé consiste principalement à analyser et à caractériser la distribution spatiale du phénomène afin d’en identifier les facteurs de risque et de caractériser, si possible, les processus qui déterminent cette distribution spatiale et de pouvoir ainsi les modéliser. L’analyse spatiale consiste également à introduire les relations spatiales (et notamment l’auto-corrélation spatiale) dans les modèles statistiques du risque.

L’analyse spatiale descriptive comprend l’analyse cartographique, la détection des caractéristiques géométriques et spatio-temporelles, l’analyse de la variabilité spatiale d’une valeur, la détection d’agrégats (clusters), la recherche d’échelles d’analyse et de synthèse, l’analyse des corrélations environnementales. L’analyse spatiale explicative est essentiellement statistique, avec l’identification de modèles statistiques impliquant des relations spatiales entre les individus et entre les individus et les caractéristiques de leur environnement.

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4. Modélisation statistique de données spatialisées

La modélisation statistique a pour objet de trouver une expression mathématique permettant d’estimer la valeur d’un attribut à partir d’un ensemble d’autres attributs, dits explicatifs. Dans le cas d’unités géographiques, la valeur à expliquer par le modèle est plutôt une moyenne, une somme, un effectif ou un ratio, alors que dans le cas d’une analyse des individus, la valeur à expliquer correspond plutôt à une probabilité ou une valeur booléenne (par exemple malade/non malade).

4.1 Modélisation statistique

L’objectif général de la modélisation statistique en épidémiologie est d’expliquer ou modéliser un risque individuel de maladie Z à partir de facteurs de risque individuels et contextuels. L’objectif est de trouver une expression fonctionnelle de type Z = f (x 1x 2, …, x n, ε), permettant de modéliser pour tous les individus la valeur étudiée en fonction de différents facteurs de risque x 1x 2, …, x n, et d’en analyser la variance et le résidu (la moyenne et la distribution des différences entre le modèle et les valeurs observées). On utilise classiquement des régressions linéaires et multilinéaires, des régressions multilinéaires généralisées, des régressions de Poisson, en fonction de la distribution observée ou supposée de Z. Par exemple, un modèle linéaire a la forme suivante :

z j = β 0 + x jk β k + ε j

x jk sont les valeurs des facteurs de risque pour l’individu j, β k les coefficients de la combinaison linéaire, et ε j une erreur aléatoire. Soit en notation matricielle :

...

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Sommaire
Sommaire

BIBLIOGRAPHIE

  • (1) - BERTIN (J.) -   Sémiologie graphique.  -  Paris, Mouton/Gauthiers-Villars (1967).

  • (2) - RICAN (S.) -   Cartographie des données épidémiologiques.  -  Cahier Santé, 8, p. 461-470 (1998).

  • (3) - BRESLOW (N.E.), DAY (N.E.) -   Statistical methods in cancer research, vol. I & II.  -  WHO, International Agency for Reseach on Cancer (1987).

  • (4) - BOUYER (J.), HEMON (D.), CORDIER (S.), DERRIENIC (F.), STUCKER (I.), STENGEL (B.), CLAVEL (J.) -   Epidémiologie, principes et methods quantitatives.  -  Inserm (1993).

  • (5) - CLAYTON (D.), KALDOR (J.) -   Empirical Bayes estimates of age-standardized relative risks for use in disease mapping.  -  Biometrics, 43(3), p. 671-681 (1987).

  • (6) - MOLLIE (A.) -   Bayesian and Empirical...

NORMES

  • The European Code of Conduct for Research Integrity – Revised Edition 2023. Berlin. DOI 10.26356/ECOC - ALLEA - 2023

1 Réglementation

France : Décret n° 2000-1282 du 26 décembre 2000 (JO du 29 décembre) portant création de l’Agence technique de l’information sur l’hospitalisation et modifiant le code de la santé publique.

Fondement législatif et réglementaire du PMSI

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2 Annuaire

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2.1 Centres de recherche et formations (liste non exhaustive)

EHESP,département METIS https://www.ehesp.fr/

UMR UVE https://www.mediterranee-infection.com/recherche/uve/

UMR 6266 CNRS IDEES

UMR Espace https://www.umrespace.org

UR0546 BioSP Biostat et process spatiaux https://biosp.mathnum.inrae.fr/

Université de Versailles http://www.ssents.uvsq.fr/

UMR 5600 EVS Université de Lyon CNRS

UMR 8524 Laboratoire Paul Painlevé Université de Lille

UMR 8504 Géographie-cités https://geographie-cites.cnrs.fr/

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