Détermination des structures 3D des macromolécules biologiques par diffraction X. Partie 2

INTRODUCTION

1 - INTRODUCTION À LA DÉTERMINATION DES PHASES

2 - MÉTHODE DE LA SÉRIE ISOMORPHE

• 2.1 - Détermination des phases : cas idéal
• 2.2 - Détermination des phases : cas réel
• 2.3 - Obtention des dérivés lourds
• 2.4 - Détermination de la position des atomes lourds

3 - UTILISATION DE LA DIFFUSION ANOMALE

• 3.1 - Travail à une seule longueur d'onde
• 3.2 - Travail à plusieurs longueurs d'onde
• 3.3 - Incorporation des diffuseurs anomaux
• 3.4 - Détermination des f′ et f′′
• 3.5 - Développements et perspectives

4 - REMPLACEMENT MOLÉCULAIRE

• 4.1 - Fonction de rotation
• 4.2 - Fonction de translation
• 4.3 - Remarques
• 4.4 - Détermination des phases

5 - CARTES DE DENSITÉ ÉLECTRONIQUE

• 5.1 - Définitions
• 5.2 - Amélioration par des méthodes de modification de densité
• 5.3 - Extension des phases
• 5.4 - Construction de la structure

6 - AFFINEMENT D'UNE STRUCTURE CRISTALLOGRAPHIQUE

• 6.1 - Introduction
• 6.2 - Principes
• 6.3 - Méthodes de moindres carrés
• 6.4 - Méthodes de la dynamique moléculaire
• 6.5 - Maximum de vraisemblance
• 6.6 - Carte de densité électronique
• 6.7 - Particularités des macromolécules biologiques

7 - VALIDATION ET CONTRÔLE QUALITÉ DES STRUCTURES

8 - BASE DE DONNÉES PDB

9 - DÉTERMINATION DES STRUCTURES À HAUT DÉBIT

10 - PERSPECTIVES