Modélisation moléculaire. Mise en oeuvre

1. Construction et mise à l’équilibre de modèles moléculaires

1.1 Molécule isolée

1.2 Boîtes de molécules avec conditions aux limites périodiques

1.3 Modèles de solides cristallins

1.4 Modèles de défauts, surfaces et interfaces : « supercellules » et « tranches »

2. Exemples d’applications physico-chimiques

2.1 Calculs thermochimiques : polymorphisme des hydroxydes d’aluminium

2.2 Équilibres en phases fluides

2.3 Adsorption

2.4 Catalyse homogène : effets de ligands sur l’activité et la sélectivité

2.5 Catalyse hétérogène : structure et propriétés électroniques de nanoparticules actives supportées

2.6 Descripteurs de l’énergie de liaison adsorbat-substrat et principe de Sabatier en catalyse hétérogène

2.7 Descripteurs moléculaires et prédiction de propriétés

Ce dossier traite en premier lieu des techniques de construction de modèles moléculaires numériques. Il propose ensuite un échantillon quelque peu éclectique, reflétant avant tout le parcours de l’auteur, de résultats de travaux illustrant la mise en oeuvre de telle ou telle technique, ou d’une combinaison de techniques, à diverses fins applicatives dans un contexte de recherche et développement.

L’ensemble [J 1 011], [J 1 012] et [J 1 013] « Bases théoriques » dresse un inventaire le plus complet possible des grandes techniques de simulation, relevant soit de la physique statistique numérique, soit de la chimie quantique, qui constituent aujourd’hui le champ large de la modélisation moléculaire : les présentations sont détaillées ou plus succinctes selon l’accent d’importance pratique attribué par l’auteur. Des renvois à des ouvrages spécialisés sont effectués si nécessaire.

Un dernier dossier [J 1 015] propose un catalogue commenté non exhaustif de l’offre commerciale et académique actuelle d’outils logiciels de modélisation moléculaire.