Bactéries
Biocorrosion

1.1 Besoins élémentaires, classification

Le besoin en eau des bactéries peut être faible, une atmosphère humide peut leur suffire. C'est pourquoi elles sont présentes dans tous les milieux : air, eau, terre.

Le besoin ou non en dioxygène permettant le développement des bactéries a conduit à leur répartition en différents groupes : aérobie stricte, anaérobie facultative, anaérobie stricte.

Un autre élément indispensable à leur survie est le carbone. Elles peuvent le trouver sous la forme de CO₂ , ces bactéries sont dites « autotrophes ». Les hétérotrophes utilisent des sources de carbone organique.

D'autres noms leur sont aussi attribués, suivant le pH du milieu qui leur est favorable : acidophile (0 < pH < 6), neutrophile (6 < pH < 8), alcalophile (8 < pH < 12), ou encore suivant le domaine de température dans lequel elles évoluent : hyperthermophile (80 à 120 ^oC), thermophile (45 à 80 ^oC), mésophile (20 à 45 ^oC), psychrophile (0 à 20 ^oC) ; la température optimale de croissance pour les hyperthermophiles est supérieure à 80 ^oC, pour les thermophiles, elle se situe entre 45 et 80 ^oC, pour les mésophiles entre 20 et 45 ^oC et finalement pour les psychrophiles la température optimale est inférieure à 15 ^oC .

Ces classifications effectuées à partir de similitudes est en cours d'évolution. Les nouvelles techniques moléculaires les redéfinissant sur des bases phylogénétiques notamment avec l'analyse des ARN 16s (acide ribonucléique ribosomique 16S).

Elle est basée sur les informations fournies par l'acide ribonucléique ribosomique (ou ARNr) produits à partir de gènes codés dans l'acide désoxyribonucléique (ou ADN). Les bactéries appartiennent à l'une des trois principales branches de l'arbre phylogénétique (figure ...