De nouveaux outils au service de l’écologie microbienne des aliments fermentés
Écosystèmes microbiens des fromages affinés - Compositions et fonctions

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De nouveaux outils au service de l’écologie microbienne des aliments fermentés
Écosystèmes microbiens des fromages affinés - Compositions et fonctions

Auteur(s) : Françoise IRLINGER, Henry-Eric SPINNLER

Date de publication : 10 avril 2020 | Read in english

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3. De nouveaux outils au service de l’écologie microbienne des aliments fermentés

3.1 De l’approche culturale et phénotypique à l’approche moléculaire et aux technologies de séquençage haut débit

L’étude de la diversité des écosystèmes microbiens s’est longtemps appuyée sur l’approche pasteurienne basée sur l’isolement, la culture sur des milieux synthétiques et l’identification des micro-organismes. Ceci a constitué une première approche essentielle dans la connaissance des micro-organismes d’un écosystème. Longue et fastidieuse, elle sous-estime cependant la diversité réelle des communautés microbiennes fromagères, du fait qu’il est impossible de détecter les micro-organismes non cultivables ou des cellules en état de dormance.

Les progrès de la biologie moléculaire associés au développement de protocoles permettant d’extraire directement...

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