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Approche et méthode
Développement logiciel en traitement d'images médicales - Bonnes pratiques et méthodologie
MED890 v1 Article de référence

Approche et méthode
Développement logiciel en traitement d'images médicales - Bonnes pratiques et méthodologie

Auteur(s) : Frédéric BANEGAS

Date de publication : 10 nov. 2013 | Read in English

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Présentation

1 - Enjeux de l'imagerie médicale

2 - Enjeux techniques et scientifiques de l'image médicale

3 - Enjeux industriels

4 - Approche et méthode

  • 4.1 - Avec qui et comment
  • 4.2 - Définition du besoin
  • 4.3 - Définition des critères de succès
  • 4.4 - Résolution du problème

5 - Synthèse

6 - Conclusion

Sommaire

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RÉSUMÉ

Cet article a pour but d'aider l'ingénieur ou le chercheur à progresser dans la mise au point de technologies de traitement d'image en imagerie médicale. Il tente de présenter le contexte, les enjeux et les méthodes qui s'appliquent à cette discipline, indépendamment de tout choix technologique. Des éléments concrets et des ouvertures à la réflexion sont proposés, afin de constituer un outil opérationnel. Enfin, une sensibilisation aux risques et aux aspects réglementaires - incontournables dans ce domaine - est également réalisée.

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Auteur(s)

  • Frédéric BANEGAS : Directeur des opérations - Docteur, Intrasense SA, Montpellier, France

INTRODUCTION

L'imagerie médicale regroupe les moyens d'acquisition et de restitution d'images du corps humain à partir de différents phénomènes physiques tels que l'absorption de rayons X, la résonance magnétique nucléaire, la réflexion d'ondes ultrasonores, la radioactivité ou plus simplement l'imagerie optique.

Elle a révolutionné la médecine en permettant, à des fins diagnostiques, de visualiser de manière non invasive et dynamique l'anatomie, la physiologie ou le métabolisme du corps humain. Cette visualisation indirecte nécessite l'emploi de techniques de traitement d'images permettant de détecter, de quantifier, de caractériser ou de filtrer les données numériques acquises.

Mettre en œuvre ces techniques avec succès est un travail d'ingénierie hautement collaboratif et de caractère très souvent translationnel, le tout dans un contexte critique qu'est celui de la préservation de la sécurité du patient.

Par-delà les techniques et méthodes de traitement d'images, le présent article va tenter d'apporter des éléments de méthodologie pour qu'un tel travail atteigne l'objectif, dans un contexte industriel ou de recherche.

Nous nous attacherons à mettre à la disposition de l'ingénieur, du chercheur ou des encadrants techniques des éléments concrets comme des étapes, des outils ou de simples questions à se poser. Les références bibliographiques permettront l'approfondissement vers des aspects plus fondamentaux ou généraux. Enfin, les notions de contexte et de finalité recherchée seront particulièrement analysées pour donner du recul au chargé de mission et permettre d'ajuster les efforts à la cible visée.

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DOI (Digital Object Identifier)

https://doi.org/10.51257/a-v1-med890

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4. Approche et méthode

Contexte et enjeux ayant été définis, nous voici à présent conscients du domaine qui nous entoure. Cette compréhension est la clé pour qu'un travail de recherche ou d'ingénierie puisse aboutir à un résultat satisfaisant.

Nous allons donc devoir résoudre un problème, et assurément de manière satisfaisante... C'est la mission qui nous est fixée ! Un peu comme à l'école, prenons d'abord le temps d'extraire les termes clés de la mission, et associons-y les bonnes questions :

  • « Problème »

    Quel est le besoin initial ? Quelles contraintes spécifiques peuvent s'y appliquer ? Comment cela va-t-il se concrétiser : démonstrateur ? produit ?

  • « Résolution »

    Quels sont les moyens dont je dispose pour pouvoir mettre en place une solution ? Combien de temps ai-je pour le faire ? Comment vais-je m'organiser ?

  •  Satisfaisant »

    Quelle est la finalité de ce travail ? Quels sont les critères de succès ? Comment saurai-je que je suis sur la bonne route ? Puis que je suis arrivé ? Quelle est la « bonne » solution ?

    Chaque mot clé suscite une multitude de questions : si l'on y répond, on doit normalement arriver à avancer, mais tout n'est pas si simple ! En effet répondre à celles-ci requiert de le faire dans un certain ordre, avec les bonnes personnes et un certain savoir-faire. Ce que nous allons essayer de proposer ici est un « guide de bonnes pratiques » qui permettra au chargé de mission de pouvoir exploiter au mieux ses connaissances techniques afin de résoudre le problème posé.

    Le diagramme proposé en figure 1 sera la cartographie générale proposée des étapes et enchaînements à mettre en œuvre dans ce contexte « à risque » qu'est le traitement d'images médicales.

4.1 Avec qui et comment

Dans tous les cas, définir le « problème », c'est-à-dire le contexte, la motivation et les critères de succès est un travail qui doit regrouper au moins les équipes ou composantes suivantes :

  • les experts : radiologues, médecins, etc. (spécialistes du domaine et représentant des utilisateurs...

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BIBLIOGRAPHIE

  • (1) - Engineering and Physical Sciences Research Council -   Report of the medical imaging technology working group.  -  Mars 2012.

  • (2) - CHRISTIAN (P.) -   De la connaissance académique à l'innovation industrielle dans les sciences du vivant : essai d'une typologie organisationnelle dans le processus d'industrialisation des connaissances.  -  CREDEN, Cahier no 02.06.27.

  • (3) - National Council of University Research Administrators -   Guiding principles for university-industry endeavors  -  (2006).

  • (4) - JEFFREY (G.), COOLEY, JENNIFER (A.B.), McKNEELY -   Command and control systems engineering : integrating rapid prototyping and cognitive engineering.  -  Johns Hopkins APL. technical digest, vol. 31, no 1 (2012).

  • (5) - BROWN, NORM -   Industrial-strength management strategies.  -  IEEE Software, vol. 13, no 4, p. 94-103, juil. 1996.

  • (6)...

1 Outils logiciels

VTK http://www.vtk.org/

ITK http://www.itk.org/

Medinria https://med.inria.fr/

HAUT DE PAGE

2 Sites Internet

Barton F. Branstetter IV, MD Basics of Imaging Informatics : Part 1 & Part 2 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17431128/ et https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17581896/ (pages consultées le 1er juin 2013)

Wikipédia : Imagerie médicale http://fr.wikipedia.org/wiki/Imagerie_m%C3%A9dicale (page consultée le 23 janvier 2013)Karl Wiegers, Ph. D 21 Project Management Success Tips http://www.projectsmart.co.uk/21-project-management-success-tips.html (page consultée le 1er juin 2013)

Wikipedia : Ingénierie concourante https://fr.wikipedia.org/wiki/Ing%C3%A9nierie_concourante (page consultée le 1er juin 2013)

Jérôme Béranger et Pierre Le Coz : Les enjeux éthiques de la télémédecine en imagerie médicale...

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