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RÉSUMÉ
La PCR (réaction de polymérisation en chaîne) digitale représente un saut technologique dans la détection et la quantification de séquences rares d'ADN, comme certaines mutations spécifiques des tumeurs. La détection de ces séquences est d'un grand intérêt pour la prise en charge clinique des patients. En effet, leur détection dans les tumeurs ou les fluides biologiques, comme le plasma ou l'urine, pourrait permettre d'adapter le traitement aux caractéristiques moléculaires précises de la tumeur et de limiter les risques de récidive. Après une rapide présentation du contexte des recherches, l'article se penche sur le cancer et ses biomarqueurs, afin d'enchaîner sur l'émergence de la PCR digitale, et enfin explore les perspectives et potentielles évolutions de la PCR digitale.
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Philippe NIZARD : Ingénieur de recherche au sein de l'UMRS1147, Université Sorbonne Paris Cité, INSERM UMR-S1147, centre universitaire des Saints-Pères, Paris, France
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Aurélie KROL : Ingénieur de recherche au sein de l'UMRS1147, Université Sorbonne Paris Cité, INSERM UMR-S1147, centre universitaire des Saints-Pères, Paris, France
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Pierre LAURENT-PUIG : PU-PH, Directeur de l'UMRS1147, Université Sorbonne Paris Cité, INSERM UMR-S1147, centre universitaire des Saints-Pères, Paris, France
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Valérie TALY : Chargée de recherche CNRS (CR1) - Responsable du groupe « Recherche translationnelle et microfluidique », Université Sorbonne Paris Cité, INSERM UMR-S1147, centre universitaire des Saints-Pères, Paris, France
INTRODUCTION
Domaine : Analyse génétique
Degré de diffusion de la technologie : Émergence | Croissance | Maturité
Technologies impliquées : Microfluidique, PCR digitale, PCR, PCR quantitative, biologie moléculaire
Domaines d'application : Recherche de biomarqueurs du cancer
Principaux acteurs français : GDR Micro et Nano Fluidique
Contact : [email protected] ; [email protected]
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4. Perspectives et évolutions
Couplée aux récents développements des séquenceurs de nouvelles générations, la commercialisation récente d'appareils de PCR digitale, et leur utilisation de plus en plus fréquente, devrait avoir un impact important sur la compréhension des processus complexes de la transformation d'une cellule saine en cellule cancéreuse. En effet, la caractérisation moléculaire des cellules cancéreuses et la corrélation entre la présence de certaines mutations et la résistance à des thérapies classiques ont permis de développer de nouveaux traitements et de proposer des traitements personnalisés dans le cadre de thérapie ciblée. L'évolution des coûts de ces deux technologies devrait conditionner, en partie, l'essor de la PCR digitale.
Un des avantages de la PCR digitale par rapport à la qPCR est que la qPCR nécessite des courbes de calibration (qui peuvent varier d'un laboratoire à l'autre et même entre deux expériences au sein d'un même laboratoire) pour la quantification, alors que la PCR digitale offre la possibilité de s'affranchir de ces variations. De plus, la PCR digitale a été décrite comme plus tolérante que la qPCR à la présence de substances inhibitrices . Cette technologie ne devrait pas supplanter la qPCR, cependant elle est en passe de devenir indispensable comme approche complémentaire offrant à la fois une meilleure sensibilité et une quantification précise.
Pour l'instant, cette technique est utilisée en recherche, mais n'est pas encore utilisée en routine clinique. Son utilisation en clinique participerait à une meilleure prise en charge du patient grâce à une détection plus précoce de la maladie ou au choix du traitement le plus adapté le plus tôt possible. La PCR digitale a également un grand potentiel pour d'autres applications comme le diagnostic prénatal, et le dosage viral. Dans le cas du diagnostic prénatal, la détection d'anomalies génétiques à partir du sang maternel est une alternative aux techniques invasives et risquées pour le fœtus.
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BIBLIOGRAPHIE
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(5) - TALY (V.), PEKIN (D.), EL ABED (A.), LAURENT-PUIG (P.) - Detecting biomarkers with microdroplet technology. - Trends. Mol. Med., 18, p. 405-416 (2012).
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