Contexte
Microfluidique et ADN tumoral - Apport de la PCR digitale

L'utilisation de la microfluidique a été récemment validée dans des tests de criblage haut débit et dans des tests diagnostiques. En particulier, la microfluidique en gouttelettes, qui utilise des gouttes de l'ordre du nanolitre (nL) au picolitre (pL) comme compartiments réactionnels pour des réactions biologiques, a démontré sa pertinence dans de nombreux champs d'applications.

Par exemple, la compatibilité des matériaux utilisés avec l'incubation de matériel biologique vivant a permis d'adapter des tests de cytotoxicité au format microfluidique, pour le criblage d'antibiotiques sur des bactéries  ou de médicaments sur des cellules eucaryotes .

Une autre de ces applications, qui sera développée ici, est la réaction de polymérisation en chaîne (PCR) au format digital qui consiste à réaliser la réaction de PCR dans un grand nombre de compartiments (entre des centaines et des millions de compartiments). La distribution de l'échantillon dans ces compartiments est réalisée de manière à n'avoir, idéalement, au plus qu'une seule séquence cible par compartiment. La lecture des résultats est réalisée par le comptage du nombre de compartiments positifs (où une amplification a eu lieu) et le nombre de compartiments négatifs.

La PCR digitale utilisée comme outil de détection quantitative de séquences rares d'ADN pourrait avoir un impact important en médecine dans la détection de virus ...