1 Outils logiciels
Chimiothèques : se reporter aux tableaux 1, 2, 3 et 4 de [PHA 1 020].
Logiciels généralistes
Discovery Studio : Accelrys, Inc., San Diego, USA
ICM : Molsoft L.L.C., San Diego, USA
Maestro : Schrödinger, New York, USA
MOE : Chemical Computing Group, Montreal, Québec, Canada
Sybyl : Tripos International, St. Louis, USA
Préparation, filtrage de chimiothèques
Corina : Molecular Networks GmbH – Computerchemie, 91052 Erlangen, Germany
LigPrep : Schrödinger, New York, USA
Pipeline Pilot : Accelrys, Inc., San Diego, USA
Screening Assistant http://www.sa2.sourceforge.net/
Recherché de similarité 2D
ISIDA http://infochim.u-strasbg.fr/spip.php?article83
Marvin, JChem : ChemAxon Kft, Budapest, Hungary
Pipeline Pilot : Accelrys, Inc., San Diego, USA
Recherche de similarité 3D
Calalyst : Accelrys, Inc., San Diego, USA
LeadIT: BioSolveIT GmbH, Sankt Augustin, Germany
LigandScout : Inte:Ligand, Vienna, Austria.
Phase : Schrödinger, New York, USA
ROCS : OpenEye Scientific Software, Santa Fe, USA
Torch, Blaze : Cresset, Hertfordshire, United Kingdom
Arrimage moléculaire
AutoDock Vina http://www.vina.scripps.edu/
Glide : Schrödinger, New York, USA
FlexX : BioSolveIT GmbH, Sankt Augustin,...